戰鬥系統 – 在野外攻擊被動攻擊的怪物數碼獸，或是攻擊主動攻擊的怪物數碼獸時，會進入戰鬥模式。戰鬥以搭檔或傭兵數碼獸對戰怪物數碼獸的方式進行，馴獸師並不會參與戰鬥。但是馴獸師可用數碼魂提升搭檔或傭兵的能力值，或是使用各種有用的技能。戰鬥結束後，搭檔或傭兵數碼獸會自動回到馴獸師身.

戰鬥流程

• 1. 發現怪物數碼獸

  在野外發現怪物數碼獸時，可用滑鼠左鍵點擊所選的怪物數碼獸，即可在畫面上方顯示名稱及HP。若無法點擊，可用Tab鍵自動選擇附近的怪物數碼獸.



• 2. 攻擊怪物數碼獸

  對怪物數碼獸雙點擊或使用熱鍵，即可發動攻擊。搭檔或傭兵數碼獸使用近戰技能時，就會嘗試靠近怪物數碼獸後發動攻擊。使用遠距離攻擊技能時，即使在遠處也能發動攻擊.



• 3. 戰鬥結束

  戰鬥時，夥伴或傭兵數碼獸與怪物數碼獸的上方會以數字顯示傷害。紅色為怪物數碼獸受到的傷害，黃色為搭檔或傭兵數碼獸受到的傷害。打倒怪物數碼獸，就可讓馴獸師與搭檔或傭兵數碼獸獲得經驗值，也可點擊倒地的怪物數碼獸所噴出來的道具，讓馴獸師獲得.



• 4. 不可戰鬥狀態

  戰鬥時，受到怪物數碼獸的攻擊使搭檔或傭兵數碼獸的HP變成0時，就會變成不可戰鬥狀態。此時無法執行任何動作，並且在畫面上方顯示警告訊息。變成不可戰鬥的狀態時，無法在原地復活，並且會自動移動到鄰近的村莊。馴獸師 Lv5.數碼獸 Lv11開始變成不可戰鬥的狀態時，會開始扣減少許的經驗值，敬請留意.

數碼魂

DS是馴獸師進化搭檔或傭兵數碼獸、維持進化狀態或數碼獸使用技能時消耗的能力。初期3名馴獸師各自有不同的DS數值，馴獸師及搭檔或傭兵數碼獸的等級提升時， DS也會漸漸的增加。DS在非戰鬥狀態時會慢慢的恢復，也可利用道具快速的恢復.

技能

搭檔或傭兵數碼獸皆有固定的戰鬥技能。技能依照數碼獸的戰鬥屬性分為近距離與遠距離攻擊。初期只能使用一個技能，隨著搭檔或傭兵數碼獸的等級提升，每提升5級可自動增加技能。技能可利用熱鍵或用滑鼠點擊技能來使用，使用技能時，會消耗數碼獸的DS.

進化

隨著搭檔或傭兵數碼獸的等級提升，可進化成更強的數碼獸。進化時，生命力、攻擊力、防禦力、技能等所有數值都會變強，因此能更輕鬆的壓制敵人。基本上搭檔數碼獸可在11級變成成熟期、25級變成完全體、41級變成究極體。傭兵數碼獸的進化等級跟搭檔數碼獸相同，但是會隨著數碼蛋狀態的等級，有不同的進化上限。數碼蛋的進化等級分為普通蛋的成熟期、高級蛋的完全體、稀有蛋的究極體.

數碼獸屬性

數碼寶貝Online中有無屬性(No)、數據(Da)、疫苗(Va)、病毒(Va)、種族不明(Un)共5種屬性。各屬性就像是剪刀石頭布一樣，有著相剋的關係，依序分別為「疫苗 < 數據 < 病毒 < 疫苗」。無屬性跟其他屬性沒有相關，種族不明則擁有比所有屬性更強的特性.

自然屬性

所有數碼獸皆有火、雷、金、風、木、水、鋼、土、冰、光、無，共11種的自然屬性。各屬性皆有相剋的關係,

(1) 火 < 水 < 冰 < 火 (2) 風 < 土 < 木 < 風 (3) 金 < 雷 < 鋼 < 光 < 金